Protein–RNA interactions for Protein: O70491

Stra6, Receptor for retinol uptake STRA6, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stra6O70491 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Stra6O70491 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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