Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cbx4O55187 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cbx4O55187 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
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