Protein–RNA interactions for Protein: O55082

Ptpn20, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 20, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn20O55082 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ptpn20O55082 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ptpn20O55082 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms