Protein–RNA interactions for Protein: O55055

Trdmt1, tRNA (cytosine(38)-C(5))-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdmt1O55055 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trdmt1O55055 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms