Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Agrn-203ENSMUST00000105575 7262 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
CrxO54751 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
CrxO54751 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms