Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
EdaO54693 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
EdaO54693 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms