Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
FxnO35943 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
FxnO35943 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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FxnO35943 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
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FxnO35943 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
FxnO35943 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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