Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Stx1aO35526 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms