Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Hps1O08983 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Hps1O08983 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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