Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
MsmbO08540 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
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