Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Ascl4M0QW46 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Ascl4M0QW46 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms