Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm3542K7N6U2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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