Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm379J3QQ19 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Gm379J3QQ19 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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