Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Gm20918J3QN17 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms