Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lipo1J3QME6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms