Protein–RNA interactions for Protein: F7BTS7

Gm5798, Predicted gene 5798, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5798F7BTS7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Gm5798F7BTS7 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Gm5798F7BTS7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms