Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
Gm5218F6YH22 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Gm5218F6YH22 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms