Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Pagr1bF6V0H0 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pagr1bF6V0H0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms