Protein–RNA interactions for Protein: F2Z403

Defa27, Defensin, alpha, 27, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa27F2Z403 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Defa27F2Z403 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms