Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmod3E9QA62 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pcdhb22-202ENSMUST00000192409 6609 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmod3E9QA62 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms