Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1
6030445D17RikE9Q8F9 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC8.77□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
6030445D17RikE9Q8F9 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms