Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M3

Gm3250, Predicted gene 3250, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3250E9Q1M3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm37858-201ENSMUST00000192759 1231 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm37853-201ENSMUST00000195748 660 ntTSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm43884-201ENSMUST00000204251 559 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 C2cd6b-201ENSMUST00000054653 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Tas2r121-201ENSMUST00000095395 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Mettl5os-201ENSMUST00000129114 667 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm38188-201ENSMUST00000192879 856 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm37502-201ENSMUST00000192981 356 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm43049-202ENSMUST00000198942 559 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 1700113A16Rik-203ENSMUST00000200006 563 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Gm3250E9Q1M3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
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