Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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Ddx60E9PZQ1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ddx60E9PZQ1 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms