Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gcom1E9PZ54 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gcom1E9PZ54 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms