Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl3-201ENSMUST00000036068 6203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Adgrl3-202ENSMUST00000072521 6203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Vpreb3D3Z6J4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms