Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms