Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm37444-201ENSMUST00000193605 439 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cspp1B2RX88 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.4 ms