Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cfap58B2RW38 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms