Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Uhrf1bp1B2KF50 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms