Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm6880A3KG45 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm6880A3KG45 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms