Protein–RNA interactions for Protein: A2ASI5

Scn3a, Sodium channel protein, mousemouse

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Length 1,947 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn3aA2ASI5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Scn3aA2ASI5 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Scn3aA2ASI5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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