Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
CtcflA2APF3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC12.9□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CtcflA2APF3 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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