Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Syndig1A2ANU3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Syndig1A2ANU3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms