Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lcn6A2AJB9 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms