Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rbbp8nlA2ABX0 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms