Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

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Length 357 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gm17190V9GX38 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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