Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
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Top3bQ9Z321 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 AL589735.1-201ENSMUST00000224353 270 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Nfe2-207ENSMUST00000134554 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Top3bQ9Z321 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms