Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Ubl3Q9Z2M6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms