Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Length 225 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cldn8Q9Z260 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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