Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Z0

Uso1, General vesicular transport factor p115, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uso1Q9Z1Z0 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Uso1Q9Z1Z0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms