Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z121

Ccl8, C-C motif chemokine 8, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl8Q9Z121 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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Ccl8Q9Z121 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Ccl8Q9Z121 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
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