Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Atp1a4Q9WV27 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Atp1a4Q9WV27 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms