Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tnfsf13bQ9WU72 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms