Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Plod3Q9R0E1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Plod3Q9R0E1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms