Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL6

Usp21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp21Q9QZL6 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm28085-201ENSMUST00000189281 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Zfp932-201ENSMUST00000099484 451 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Usp21Q9QZL6 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 1700084C06Rik-201ENSMUST00000135674 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Hrc-202ENSMUST00000211327 607 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Usp21Q9QZL6 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms