Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ47

Tnnt3, Troponin T, fast skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt3Q9QZ47 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tnnt3Q9QZ47 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tnnt3Q9QZ47 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms