Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Cml5Q9QXS8 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Nup160-201ENSMUST00000057481 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Cml5Q9QXS8 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms