Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cpsf3Q9QXK7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cpsf3Q9QXK7 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms