Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVN7

Tcea2, Transcription elongation factor A protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcea2Q9QVN7 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tcea2Q9QVN7 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Tcea2Q9QVN7 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm25116-201ENSMUST00000157191 122 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tcea2Q9QVN7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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