Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Nectin3Q9JLB9 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms